接著净化一切自他能所之现象界,以生起此修法纯净之地基。一切存在之现象尽无余地化空,无禅修、禅修者,亦无禅修之对象;万法非存亦非不存,因无法舆非法,故无所谓修舆修者。然後持诵观空咒:「OM SHUNYATA JANA BENZA SOBHAWA AYMA KO HANG」。一切主客现象均为空性,然此空性并非虚无,而是一切诸佛之特质。
然後,观想在佛父心中有本尊心咒:「OM HUNG CHA MALA WA RA YA SOHA」站立(时轮金刚之种子字文HUM字),表一切轮回、涅槃之现象的精髄无二。(我们可藉助此咒鬘之唐卡使我们易观想。)我们持咒时需要观想此时轮金刚之心咒放无量光至十方,使全宇宙净化成本尊宫殿、众生完全被净化,十分快乐并转化成时轮金刚本尊。